Những gì phòng thí nghiệm bỏ lỡ nếu không có giá từ tính để phân lập RNA

Giá đỡ từ tính để phân lập RNA không chỉ là một giá đỡ đơn giản trên băng ghế của bạn. Nó là một công cụ từ tính kéo các hạt liên kết với RNA xuống và giữ chúng cố định trong khi bạn loại bỏ hoặc thêm chất lỏng. Bước nhỏ này hỗ trợ nhiều quy trình làm việc lớn: chiết xuất RNA vi-rút, chuẩn bị thư viện giải trình tự thế hệ tiếp theo, nghiên cứu sinh thiết lỏng và sàng lọc chẩn đoán thông lượng cao. Trong nhiều nghiên cứu mang tính bước ngoặt, các phương pháp RNA dựa trên hạt từ tính đã giúp các phòng thí nghiệm mở rộng quy mô xử lý mẫu và cải thiện tính nhất quán, đặc biệt là khi các cột quay quá chậm hoặc dễ vỡ. Ngày nay, các công ty công nghệ sinh học và các cơ sở cốt lõi dựa vào giá đỡ từ tính để giữ cho quy trình làm việc RNA sạch sẽ, nhanh chóng và có thể tái tạo. Tuy nhiên, một số nhóm vẫn coi giá đỡ như một phụ kiện chung, không phải là một phần quan trọng của giao thức. Giả định thầm lặng đó đi kèm với chi phí ẩn chỉ hiển thị trong dữ liệu của bạn sau này. Vậy chính xác thì các phòng thí nghiệm còn thiếu điều gì nếu không có giá đỡ từ tính chuyên dụng - và nó thực sự quan trọng đến mức nào?

(Hạt từ tính (microRNA & Oligo Purification) - BioDynami)

Ma sát hàng ngày tôin Chiết xuất RNA tmũ Không ai theo dõi

Trên giấy tờ, hầu hết các quy trình chiết xuất RNA trông chắc chắn. Bộ công cụ được xác thực, SOP được viết và mọi người đều biết các bước. Nhưng khi bạn bước vào băng ghế dự bị, thực tế lại khác.

Các kỹ thuật viên vẫn chiến đấu với khối lượng nhỏ trong các ống hẹp. Hạt không phải lúc nào cũng dễ nhìn thấy. Nổi trên đôi khi đi ra ngoài quá nhanh. Một cái búng tay nhỏ có thể làm xáo trộn viên nén. Không có khoảnh khắc nào trong số này tự cảm thấy kịch tính, nhưng chúng từ từ làm hỏng chất lượng dữ liệu.

Nếu không có Giá đỡ từ tính chuyên dụng để phân lập RNA, các lỗi nhỏ sẽ chồng chất:

• Pipet trở thành phỏng đoán khi hạt hạt bị ẩn hoặc không đồng đều.

• Mất RNA len lỏi trong quá trình loại bỏ phần nổi trên hoặc các bước rửa.

• Chất gây ô nhiễm ở trong ống vì quá trình tách không hoàn toàn.

Bạn có thể không nhận thấy nó trên một đĩa mẫu. Nhưng bạn thấy điều đó trong dài hạn: sự thay đổi bất ngờ về năng suất RNA, lặp lại thêm và bộ dữ liệu khó giải thích hơn cho cộng tác viên hoặc QA.

Một vấn đề vô hình khác là từ trường. Nếu giá đỡ không cung cấp từ trường đồng đều, ổn định trên tất cả các giếng hoặc ống, các hạt sẽ thu thập ở các tốc độ khác nhau hoặc theo các mẫu khác nhau. Điều đó có nghĩa là cùng một giao thức có thể cho kết quả khác nhau ở bên trái và bên phải của cùng một giá đỡ. Hệ số biến đổi tăng lên và khả năng tái tạo lặng lẽ giảm.

Yếu tố con người cũng đóng một vai trò. Giá đỡ không tiện dụng buộc nhân viên phải cúi xuống băng ghế, xoắn ống hoặc duy trì tay cầm vụng về trong thời gian dài. Các phòng thí nghiệm thông lượng cao cảm nhận được điều này một cách sâu sắc. Những gì trông giống như một sự kém hiệu quả nhỏ trở thành hàng giờ làm thêm mỗi tuần, cộng với nguy cơ mắc sai lầm liên quan đến mệt mỏi cao hơn.

Nói tóm lại, các phòng thí nghiệm không có Giá đỡ từ tính được thiết kế tốt để phân lập RNA thường phải trả một "thuế lỗi" ẩn. Họ dành thời gian khắc phục sự cố thay vì tạo dữ liệu và họ lặp lại các thử nghiệm lẽ ra phải hoạt động ngay lần đầu tiên.

Làm thế nào một Giá đỡ từ tính để phân lập RNA Thay đổi tTrò chơi

Một Hiện đại Giá đỡ từ tính để phân lập RNA được chế tạo xung quanh nam châm vĩnh cửu hiệu suất cao tạo ra từ trường mạnh nhưng nhẹ nhàng. Vật lý rất phức tạp, nhưng lợi ích trên băng ghế dự bị rất đơn giản.

Khi từ trường đồng đều, các hạt di chuyển nhanh chóng và lắng xuống các vùng tập hợp rõ ràng trên thành ống hoặc đáy. Bạn có thể thấy chính xác vị trí của hạt - và RNA của bạn - ở đâu. Khả năng hiển thị đó mang lại cho bạn sự tự tin khi hút phần nổi trên, thêm dung dịch đệm rửa hoặc rửa trôi sản phẩm cuối cùng của bạn.

Thay vì "hy vọng" viên nén vẫn ở đúng vị trí, các kỹ thuật viên có thể thấy rằng nó đã làm như vậy. Kết quả là:

• Phục hồi cao hơn sau mỗi lần chiết xuất

• Ít vật liệu bị mất trong quá trình giặt

• CV chặt chẽ hơn giữa các lô và giữa các nhà khai thác

• Thời gian chờ ngắn hơn để các hạt tách ra

Một giá đỡ tốt cũng được thiết kế xung quanh quy trình làm việc trong phòng thí nghiệm thực tế. Ống dễ dàng lắp và tháo. Các vị trí cảm thấy trực quan. Giá đỡ nằm chắc chắn trên băng ghế, vì vậy bạn không phải đuổi theo nó trên bề mặt mỗi khi thay đĩa. Sự thoải mái đơn giản về mặt công thái học này giúp giảm căng thẳng, đặc biệt là khi bạn xử lý hàng chục hoặc hàng trăm mẫu trong một lần chạy.

Tính linh hoạt là một lợi thế thầm lặng khác. Nhiều giá đỡ cao cấp hỗ trợ thể tích làm việc chỉ từ vài microlit đến khoảng 50 mL. Bạn có thể sử dụng chúng với ống hoặc dải PCR 0,2 mL, ống ly tâm siêu nhỏ 1,5 / 2,0 mL tiêu chuẩn và ống hình nón lớn hơn 15 hoặc 50 mL. Một giải pháp bao gồm các thí nghiệm sàng lọc nhỏ và công việc chuẩn bị lớn hơn mà không cần thay đổi thiết bị liên tục.

Mặc dù chúng tôi tập trung ở đây vào RNA, Giá đỡ từ tính để phân lập RNA hiếm khi bị giới hạn trong một giao thức. Phần cứng tương tự có thể hỗ trợ:

• Chiết xuất và làm sạch DNA

• Dọn dẹp thư viện sau PCR hoặc các phản ứng enzym khác

• Tinh chế protein bằng cách sử dụng hệ thống ái lực hạt từ tính

• Làm giàu hoặc cạn kiệt tế bào bằng hạt từ tính

Điều đó có nghĩa là một khoản đầu tư duy nhất sẽ cải thiện nhiều quy trình làm việc, không chỉ một. Theo thời gian, điều này làm giảm chi phí cho mỗi lần chạy và đơn giản hóa việc đào tạo vì nhân viên học một phần cứng mà họ có thể sử dụng trên nhiều ứng dụng.

Lời kêu gọi hành động: Trước khi bạn thay đổi lại giao thức, hãy xem phần cứng tách của bạn. Một thiết kế tốt Giá đỡ từ tính để phân lập RNA có thể là cách nhanh nhất để giảm lỗi và mở khóa thông lượng hàng ngày cao hơn.

Ký tên's Thời gian to Nâng cấp giá đỡ từ tính của bạn

Làm thế nào bạn có thể biết liệu thiết lập hiện tại của bạn có đủ tốt hay chủ động hạn chế kết quả của bạn hay không? Một vài câu hỏi thực tế giúp làm rõ bức tranh.

Các nhà khai thác khác nhau có nhận được năng suất khác nhau đáng kể từ cùng một bộ phân lập RNA không? Nếu có, quy trình của bạn có thể quá nhạy cảm với kỹ thuật cá nhân. Giá đỡ có từ trường đồng đều hơn và vùng kết tụ hạt rõ ràng hơn có thể giảm khoảng cách giữa người vận hành với người vận hành.

Thời gian thực hành có tăng lên khi số lượng mẫu của bạn tăng lên không? Ví dụ, khi bạn đang chế biến nhiều tấm liên tiếp, chờ đợi các hạt lắng xuống hoặc cẩn thận "giải cứu" các viên không ổn định có thể nhanh chóng tích tụ. Giá đỡ từ tính hiệu quả hơn để phân lập RNA đẩy nhanh các bước này và hỗ trợ hoạt động thông lượng cao mượt mà hơn.

Bạn đang chạy lặp lại vì kết quả QC không rõ ràng, ngoại lệ lạ hoặc chất lượng thư viện không nhất quán? Mặc dù nhiều yếu tố ảnh hưởng đến QC, nhưng sự tách biệt kém có thể là một yếu tố chính. Việc bắt hạt không hoàn chỉnh, vón cục hạt hoặc các chất gây ô nhiễm còn sót lại đều hiển thị sau đó dưới dạng nhiễu trong dữ liệu của bạn.

Khi bạn bắt đầu tìm kiếm một giá đỡ mới, hãy tập trung vào một số tiêu chí cốt lõi:

• Hiệu suất từ tính - Đủ mạnh để tách nhanh, nhưng không quá mạnh đến mức các hạt vón cục hoặc trở nên khó treo lại.

• Tính nhất quán - Hiệu suất ổn định với CV chặt chẽ qua nhiều lô và trên tất cả các vị trí trên giá.

• Công thái học - Một thiết kế tạo cảm giác thoải mái và trực quan khi sử dụng hàng ngày, giảm căng thẳng và sai sót.

• Khả năng tương thích - Hỗ trợ các định dạng ống và khối lượng làm việc bạn thực sự sử dụng, từ ống PCR nhỏ đến ống siêu nhỏ hoặc hình nón lớn hơn.

Khả năng hiển thị đáng để gọi riêng nó. Giá đỡ giúp các vùng hạt dễ nhìn thấy cung cấp cho kỹ thuật viên phản hồi ngay lập tức. Họ biết khi nào bước tách hoàn tất, khi nào là an toàn để hút và bao nhiêu chất lỏng còn lại có thể chấp nhận được. Điều khiển trực quan này giúp bảo vệ các mẫu quý giá và giúp giới thiệu nhân viên mới dễ dàng hơn đáng kể.

Cuối cùng, giá đỡ từ tính không chỉ là một khối giữ các ống bên cạnh nam châm. Nó là một phần của cơ sở hạ tầng chất lượng phòng thí nghiệm của bạn. Khi hoạt động tốt, dữ liệu của bạn sẽ sạch hơn, quy trình làm việc của bạn mượt mà hơn và nhóm của bạn dành ít thời gian hơn để chữa cháy và có nhiều thời gian hơn để phân tích kết quả có ý nghĩa.

Lời kêu gọi hành động: Lấy một trong những quy trình làm việc RNA hiện tại của bạn và tưởng tượng nó với khả năng hiển thị hạt rõ ràng hơn, tách nhanh hơn và xử lý thoải mái hơn cho nhóm của bạn. Nếu đó nghe có vẻ là hướng đi mà phòng thí nghiệm của bạn cần đi, thì bây giờ là thời điểm tốt để đánh giá Giá đỡ từ tính được nâng cấp để phân lập RNA từ Công nghệ Longlight và đưa công việc hàng ngày của bạn phù hợp với chất lượng khoa học của bạn.