Mẫu phức tạp? Máy siêu âm một cửa để chiết xuất DNA

Máy siêu âm để chiết xuất DNA tập trung năng lượng âm thanh tần số cao vào một môi trường vi mô kín. Nó ly giải tế bào và giải phóng axit nucleic trong môi trường kín, không tiếp xúc, đồng thời kiểm soát chặt chẽ nhiệt độ để duy trì tính toàn vẹn của DNA. Khi được yêu cầu, phơi nhiễm âm thanh có kiểm soát cũng có thể được áp dụng cho sự phân mảnh hạ lưu. Nó hỗ trợ các ma trận không đồng nhất, nhớt hoặc sinh khối thấp. Điều gì cho phép kiểm soát và tái tạo như vậy và làm thế nào nó có thể chuẩn hóa quy trình làm việc của bạn? Các chi tiết và bằng chứng sau đây.

Là gì mộtn Máy siêu âm fhay Chiết xuất DNA?

Máy siêu âm để chiết xuất DNA là một hệ thống âm thanh tập trung âm thanh tần số cao, bước sóng ngắn vào một vùng mẫu được xác định chặt chẽ. Thay vì nhúng đầu dò kim loại hoặc dựa vào bồn tắm thông thường, thiết bị cung cấp năng lượng thông qua môi trường âm thanh mà không cần chạm vào mẫu. Bằng cách loại bỏ tiếp xúc trực tiếp, nó làm giảm nguy cơ ô nhiễm, tránh tạo ra bình xịt và hạn chế các hiện vật do nhiệt có thể làm lệch cấu hình mảnh.

Tại Longlight Technology, chúng tôi sử dụng hình học âm thanh tập trung để duy trì môi trường ổn định, gần đẳng nhiệt trong quá trình xử lý. Các mẫu vẫn được niêm phong trong các ống kín, trong khi năng lượng siêu âm được đo chính xác sẽ phân đoạn DNA hoặc phá vỡ các tế bào và mô. Phương pháp tiếp cận ống kín, không tiếp xúc này luôn tạo ra sự phân bố kích thước mảnh hẹp và phục hồi ổn định qua các lần chạy. Nó tỏa sáng với các ma trận đầy thách thức - màng sinh học, mẫu lâm sàng nhớt, mô được xử lý bằng formalin - nơi đầu dò cũ hoặc siêu âm bồn tắm nước thường rất khác nhau. Nói tóm lại, một máy siêu âm hiện đại để chiết xuất DNA tích hợp âm thanh nhẹ nhàng, được kiểm soát chính xác với tính nhất quán mạnh mẽ, cho phép thành công trong quy trình làm việc của bộ gen và proteomics.

Nghiên cứu toàn cầu mộtCác trường hợp sử dụng đã được chứng minh

Siêu âm tập trung có hồ sơ theo dõi sâu sắc trên các đường ống giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS), sinh học nhiễm sắc thể và vi sinh vật. Nó là trụ cột cho phân mảnh DNA trong xây dựng thư viện và cắt nhiễm sắc trong ChIP-Seq và các xét nghiệm liên quan.

• Các nhà điều tra như Elaine R. Mardis (Trung tâm Bộ gen Đại học Washington) và Jay Shendure (Đại học Washington) đã trình bày chi tiết các giao thức cắt âm thanh ống kín cho các thư viện NGS, nhấn mạnh sự phân bố mảnh chặt chẽ, mất mẫu thấp và cải thiện khả năng tái tạo so với các phương pháp dựa trên đầu dò.

(Elaine R. Mardis và Jay Shendure, 2010, Sự đa dạng của biến thể số bản sao của con người và gen đa bản sao)

• Các nhóm thông lượng cao, bao gồm Viện Broad và Hiệp hội ENCODE, mô tả sự phân mảnh DNA dựa trên siêu âm và gián đoạn nhiễm sắc trong các phương pháp đã công bố, nhấn mạnh sự chấp nhận rộng rãi của âm thanh tập trung trong môi trường được quy mô, quy định.

(Giới thiệu về dữ liệu ENCODE tại UCSC)

• Các nhóm vi sinh lâm sàng áp dụng MALDI-TOF MS phụ thuộc vào siêu âm được tối ưu hóa để phá vỡ các sinh vật có khả năng phục hồi - nấm sợi, Mycobacterium - cung cấp các chất ly giải đồng nhất giúp tăng tín hiệu quang phổ trên nhiễu và nâng cao độ chính xác nhận dạng.

(MALDI-TOF MS Mycobacterium Speciation | Giá thử nghiệm ở Delhi | Chẩn đoán Ganesh)

• Các phòng thí nghiệm mô bệnh học ngày càng sử dụng âm thanh tập trung để khử parafin các phần FFPE và thu hồi axit nucleic trong điều kiện nhiệt độ thấp, duy trì tính toàn vẹn cho PCR, giải trình tự và lập hồ sơ protein.

(Chiết xuất FFPE | Covaris)

Kết hợp với nhau, những ví dụ này cho thấy cách Máy siêu âm để chiết xuất DNA cho phép các phương pháp tiêu chuẩn hóa, có thể truy xuất nguồn gốc trên các chương trình đa địa điểm đồng thời giảm sự thay đổi thủ công và trôi dạt giữa người vận hành.

Ánh sáng dài's Một-Dừng siêu âm: Thiết kế mộtnd Ưu điểm

Máy siêu âm để chiết xuất DNA được thiết kế để giải phóng DNA một cách hiệu quả mà không bị phân mảnh quá mức ngoài ý muốn. Phân mảnh chỉ được áp dụng khi quy trình làm việc yêu cầu rõ ràng. Là một nhà sản xuất, Longlight Technology thiết kế cho một kết quả: dữ liệu có thể tái tạo từ các mẫu phức tạp với nỗ lực tối thiểu của người vận hành. Của chúng tôi Một-dừng siêu âm để chiết xuất DNA Kết hợp thông lượng đa kênh, quản lý nhiệt độ chủ động và truy xuất nguồn gốc dữ liệu đầy đủ trong một hệ thống nhỏ gọn, thân thiện với băng ghế dự bị được thiết kế để sử dụng hàng ngày.

Thông lượng linh hoạt bắt đầu với 16 vị trí giếng. Xử lý một mẫu quan trọng hoặc một giá đầy đủ 16 mẫu trong một phiên. Mỗi vị trí có thể chạy một cấu hình âm thanh độc lập - chu kỳ làm việc, mật độ công suất, tổng độ phơi sáng - vì vậy bạn có thể điều chỉnh cài đặt cho thành phần mẫu. Đối với ma trận thông thường, chế độ hàng loạt cho phép bạn nhập các thông số một lần và thực hiện xử lý bằng một cú nhấp chuột trên tất cả các mẫu tương tự, giảm thời gian và lỗi thiết lập.

• Xử lý không tiếp xúc: Siêu âm được ghép nối thông qua một đường dẫn chất lỏng mà không tiếp xúc trực tiếp với mẫu, giảm thiểu ô nhiễm chéo, hình thành bình xịt và mang theo.

• Kiểm soát đẳng nhiệt, nhiệt độ thấp ổn định: Cảm biến có độ chính xác cao và phản hồi vòng kín giữ cho một lớp vỏ nhiệt chặt chẽ, duy trì tính toàn vẹn của DNA và hạn chế sự thiên vị do nhiệt gây ra trong quá trình cắt hoặc ly giải.

• Hoạt động yên tĩnh: Kỹ thuật giảm tiếng ồn âm thanh loại bỏ yêu cầu đối với vỏ âm thanh quá khổ, lý tưởng cho các lõi dùng chung và thiết lập băng ghế điển hình.

• Truy xuất nguồn gốc từ đầu đến cuối: Tự động nắm bắt các thông số chạy, dấu thời gian và đầu ra dữ liệu hỗ trợ kiểm tra, chương trình đào tạo và xác nhận phương pháp giữa các nhóm.

• Thoát nước tự động: Tự động lọc chất thải chỉ bằng một cú chạm, với cảm biến mức và thông báo tràn sớm, giảm gánh nặng bảo trì và hạn chế tiếp xúc.

• Hệ điều hành tích hợp: Hệ điều hành nhúng loại bỏ PC bên ngoài, thu hẹp thiết lập và cho phép triển khai nhanh chóng trong các khu vực phòng thí nghiệm hạn chế.

Sơ đồ đồng tiêu hướng năng lượng một cách chính xác, ngăn chặn tổn thất vào môi trường ghép nối và kiểm soát chặt chẽ hơn việc tiếp xúc. Các thiết bị được hiệu chỉnh tại nhà máy dựa trên các tham chiếu để mang lại hiệu suất đồng nhất - rất quan trọng đối với các nghiên cứu đa địa điểm và quy trình làm việc được quy định đòi hỏi khả năng so sánh.

Ứng dụng mộtnd Điểm khó khăn trong ngành mà chúng tôi giải quyết

Các mẫu phức tạp có thể nhanh chóng tiết lộ giới hạn của các phương pháp siêu âm cũ hơn. Hệ thống đầu dò có thể đưa chất gây ô nhiễm, tạo ra bình xịt và cung cấp năng lượng không đồng đều từ ống này sang ống khác. Nồi cách thủy chung có thể làm nóng mẫu không thể đoán trước, dẫn đến phân bố mảnh sai lệch hoặc cắt quá mức. Thông lượng là một nút thắt cổ chai khác: các phòng thí nghiệm thường lựa chọn giữa độ chính xác của ống đơn và hiệu quả hàng loạt.

Máy siêu âm để chiết xuất DNA từ Công nghệ Longlight giải quyết những hạn chế này bằng âm thanh chính xác, không tiếp xúc; các kênh độc lập để điều chỉnh mỗi mẫu; và các lần chạy hoàn toàn có thể theo dõi.

• Phân mảnh bộ gen trong NGS: Tạo ra các phân bố phân đoạn chặt chẽ, có thể nhắm mục tiêu - ngay cả từ gDNA MW cao - để tăng độ phức tạp của thư viện và giảm nhu cầu lựa chọn kích thước.

• Phân mảnh nhiễm sắc và ly giải tế bào/mô: Áp dụng kiểm soát nhiệt nghiêm ngặt trong quá trình ly giải và phân mảnh để bảo vệ epitope và ổn định phức hợp protein - DNA để lập hồ sơ omics hạ nguồn.

• Khử parafin FFPE: Loại bỏ parafin nhiệt độ thấp giúp cải thiện tính toàn vẹn của axit nucleic và protein cho các ứng dụng giải trình tự và xét nghiệm miễn dịch.

• Chuẩn bị MALDI-TOF MS: Chuẩn hóa quy trình ly giải cho nấm dạng sợi và Mycobacterium để làm sắc nét khối phổ và tăng cường sự tự tin trong các cuộc gọi cấp loài.

• Đồng nhất mô sinh học: Tạo ra huyền phù đồng nhất mà không cần tiếp xúc cơ học trực tiếp, cho phép chiết xuất RNA / DNA sạch hơn và proteomics với ít hiện vật hơn.

Truy xuất nguồn gốc và an toàn là tiêu chuẩn. Chạy siêu dữ liệu và kết quả được ghi lại cho các dấu vết kiểm tra. Tự động xả và phát hiện tràn hợp lý hóa việc tuân thủ, giảm thời gian tiếp xúc của người vận hành và giữ cho băng ghế gọn gàng. Hoạt động có độ ồn thấp phù hợp với môi trường dùng chung mà không cần thêm vỏ bọc hoặc cơ sở hạ tầng.

Thực hiện, Đảm bảo chất lượng, mộtCuộc gọi thứ hai tHành động

Triển khai Máy siêu âm một cửa của chúng tôi để chiết xuất DNA rất đơn giản. Bắt đầu với một thí điểm phù hợp với hỗn hợp mẫu của bạn, bao gồm vật liệu nhớt, sinh khối thấp hoặc FFPE. Sử dụng điều chỉnh mỗi giếng cho các ngoại lệ và chế độ hàng loạt cho các bộ thông thường. Xác nhận với các tiêu chuẩn QC của bạn - định cỡ vi lỏng, điện di mao dẫn hoặc năng suất qPCR - để xác minh cấu hình mảnh và phục hồi. Sau đó, khóa các mẫu phương pháp để các lần chạy trong tương lai chỉ bằng một cú nhấp chuột, hoàn toàn có thể theo dõi và nhất quán giữa các nhà khai thác và ca làm việc.

• Các khả năng chính fhoặc Phức tạp Samples

• Xử lý 1 - 16 mẫu mỗi buổi; Kết hợp cấu hình mỗi giếng tùy chỉnh với hồ sơ lô nếu cần.

• Duy trì môi trường đẳng nhiệt, được kiểm soát chặt chẽ với các cảm biến có độ nhạy cao để bảo vệ chất lượng DNA.

• Hoạt động yên tĩnh trong không gian phòng thí nghiệm tiêu chuẩn; không cần PC bên ngoài hoặc vỏ âm thanh.

• Truy xuất dữ liệu chạy hoàn chỉnh và dấu vết kiểm tra để hỗ trợ đào tạo, theo dõi khả năng tái tạo và tuân thủ.

Bắt đầu với một Phi công

Chúng tôi khuyên bạn nên thực hiện một nghiên cứu khả thi ngắn bằng cách sử dụng các mẫu điển hình của bạn - ma trận nhớt, mẫu đầu vào thấp hoặc phần FFPE - để nhóm ứng dụng của chúng tôi có thể ánh xạ cài đặt âm thanh với mục tiêu của bạn. Điều này giúp giảm thời gian xác thực, đẩy nhanh quá trình tạo SOP và dễ dàng chuyển sang các hoạt động được quy định hoặc thông lượng cao.

Công nghệ Longlight cung cấp thiết bị, giao thức và hỗ trợ để làm cho việc chuẩn bị mẫu phức tạp có thể dự đoán và lặp lại. Máy siêu âm để chiết xuất DNA của chúng tôi cung cấp quy trình xử lý không tiếp xúc, kiểm soát nhiệt độ thấp thực sự, hoạt động yên tĩnh, quy trình làm việc có thể truy xuất nguồn gốc và cả chạy hàng loạt và tùy chỉnh - được tăng cường bằng hệ thống thoát nước tự động và hệ điều hành tích hợp.

Kêu gọi hành động

Bạn đã sẵn sàng chuẩn hóa quy trình làm việc DNA của mình chưa? Gửi email cho Longlight Technology để yêu cầu bản demo, gửi mẫu thử nghiệm để đủ điều kiện hoặc sắp xếp tư vấn giao thức. Trang bị cho nhóm của bạn Máy siêu âm một cửa để chiết xuất DNA được chế tạo cho các mẫu phức tạp và khả năng tái tạo đáng tin cậy.