Hướng dẫn tăng tốc quy trình làm việc điện di RNA | Một bước từ chụp đến đầu ra hình ảnh

Là một kỹ thuật đã được chứng minh đằng sau những khám phá mang tính bước ngoặt, điện di RNA vẫn là cơ sở để xác định kích thước RNA, đánh giá tính toàn vẹn và lập hồ sơ xử lý. Từ minh chứng năm 1998 của Andrew Z. Fire và Craig C. Mello về giao thoa RNA, trong đó điện di RNA và Northern blotting giúp theo dõi các RNA sợi đôi và nhỏ can thiệp, đến việc xác định vi RNA lin-4 năm 1993 của Victor Ambros, Rosalind Lee và Rhonda Feinbaum bằng cách sử dụng điện di RNA polyacrylamide, kỹ thuật này đã neo đậu sinh học phân tử hiện đại. Trước đó, công trình của Phillip A. Sharp và Richard J. Roberts về nối RNA và các nghiên cứu của Thomas R. Cech về các intron tự nối, đã sử dụng phân tích dựa trên gel để giải quyết các sản phẩm nối và các chất trung gian RNA.

(Andrew Z. Lửa | Nhà di truyền học người Mỹ đoạt giải Nobel | Britannica)

Tại Longlight Technology, chúng tôi xây dựng các hệ thống đẩy nhanh quy trình làm việc thiết yếu này để các nhà nghiên cứu có thể chuyển từ gel sang quyết định nhanh hơn, với chất lượng nhất quán và dữ liệu có thể truy xuất nguồn gốc.

Điện di RNA là gì?

Điện di RNA tách RNA theo kích thước thông qua ma trận gel agarose hoặc polyacrylamide được điều khiển bởi điện trường. Nó cho phép xem các dải RNA ribosome để kiểm tra tính toàn vẹn, đánh dấu sự suy thoái và giải quyết các RNA nhỏ. Phương pháp này cũng cung cấp thức ăn cho Northern blotting bằng cách chuẩn bị RNA phân đoạn kích thước để lai tạo. Trong các phòng thí nghiệm thông thường, điện di RNA xác nhận chất lượng mẫu trước khi RT-qPCR, RNA-seq hoặc xây dựng thư viện, đồng thời xác nhận các bước quy trình làm việc như phân mảnh hoặc thắt bộ chuyển đổi.

Thực hành hiện đại đòi hỏi hình ảnh rõ ràng trong môi trường mờ, khả năng tương thích thuốc nhuộm / vết bẩn trên phạm vi rộng và định lượng đáng tin cậy. Với độ nhạy của RNA với RNase và tia UV, việc điều chỉnh cẩn thận các điều kiện hình ảnh là không thể thiếu. Công nghệ Longlight cung cấp một nền tảng hình ảnh gel hợp nhất phù hợp với Điện di RNA và sử dụng axit nucleic rộng rãi hơn, tích hợp quang học chính xác, xử lý tự động và xử lý an toàn đầu tiên trong một kích thước nhỏ gọn.

(MicroRNA: Chức năng, Phát hiện và Phân tích Sinh học | Đánh giá hóa học)

Điểm khó khăn trong ngành tôin Điện di RNA

Nhiều nhóm gặp phải tình trạng tắc nghẽn chung khi chụp ảnh gel RNA:

• Quy trình làm việc phân mảnh. Các mô-đun khác nhau cho kích thích, quang học và phần mềm buộc chuyển giao và trì hoãn.

• Chú thích thang thủ công. Việc dán nhãn kích thước dây đeo bằng tay cần có thời gian và có thể mang tính chủ quan.

• Độ nhạy ánh sáng yếu. Các dải yếu từ các RNA có độ phong phú thấp bị che khuất hoặc bỏ sót giữa tiếng ồn.

• Rủi ro an toàn. Tiếp xúc với tia cực tím trong quá trình cắt bỏ gel làm tăng nguy cơ người dùng và đòi hỏi sự che chắn nghiêm ngặt.

• Truy xuất nguồn gốc dữ liệu. Dấu vết kiểm tra không đầy đủ, vai trò của người dùng không rõ ràng và nhật ký nằm rải rác.

• Khoảng cách tương thích. Thuốc nhuộm, nguồn sáng và phần mềm không khớp làm gián đoạn các giao thức tiêu chuẩn.

Kết quả là các thử nghiệm chậm hơn, tài liệu không đồng đều và rủi ro tuân thủ tiềm ẩn. Giải pháp này là một lộ trình tích hợp, một bước giúp duy trì chất lượng đồng thời loại bỏ các tác vụ lặp đi lặp lại.

Công nghệ Longlight'Quy trình làm việc một bước - fChụp rom to Đầu ra hình ảnh

Công nghệ Longlight đã thiết kế một Hệ thống hình ảnh gel tất cả trong một để hợp lý hóa quá trình điện di RNA từ chụp đến đầu ra hình ảnh. Mục tiêu rất đơn giản: giảm nhấp chuột, tăng độ rõ ràng và duy trì khả năng truy xuất nguồn gốc trong một lần vượt qua.

• Chụp

Hệ thống quang học có độ nhạy cao kết hợp với các nguồn sáng UV, xanh lam và trắng truyền qua để hỗ trợ nhiều loại thuốc nhuộm RNA. Máy ảnh CMOS độ nhạy cao 6,3 MP ghi lại các dải rõ ràng, nguyên vẹn trong điều kiện ánh sáng yếu, cải thiện khả năng phát hiện các RNA có độ phong phú thấp. Phơi sáng tự động và lấy nét tự động ổn định hình ảnh mà không cần điều chỉnh thủ công.

• Quy trình

Xử lý hình ảnh tích hợp chạy trực tiếp trên thiết bị. Màn hình cảm ứng 12,1 inch hỗ trợ điều khiển mượt mà, nâng cao hình ảnh và xem lại nhanh chóng mà không cần máy tính bên ngoài. Điều này giảm thiểu việc truyền tệp và giảm sự thay đổi xử lý giữa các toán tử. Giao diện được xây dựng cho các SOP có thể lặp lại.

• Chú thích mộtnd Dấu vết

Tự động chú thích điểm đánh dấu nhận dạng kích thước dải bậc thang và tự động gắn nhãn chúng, cắt giảm các chỉnh sửa thủ công và thiên vị người vận hành. Vai trò người dùng được xác định, danh mục nhật ký có thể lọc và dấu vết kiểm tra từ đầu đến cuối cung cấp khả năng truy xuất nguồn gốc cho mọi tập dữ liệu giữa các nhóm. Kết quả được kết hợp với siêu dữ liệu nhất quán, hợp lý hóa các nghĩa vụ giám sát và tuân thủ nội bộ.

Với quy trình làm việc một bước này, điện di RNA tiến hành từ vị trí gel đến hình ảnh được chú thích cuối cùng trên một thiết bị duy nhất. Không cần chuyển đổi giữa các nền tảng, không vẽ thang thủ công và không có nhật ký bị mất.

Điểm nổi bật về kỹ thuật fhoặc Hình ảnh điện di RNA

Longlight Technology xây dựng các hệ thống để đáp ứng nhu cầu nghiêm ngặt của phòng thí nghiệm đồng thời giảm tổng chi phí sở hữu. Các khả năng chính cho điện di RNA bao gồm:

• Quang học có độ nhạy cao. Máy ảnh CMOS 6,3 MP giúp giảm tiếng ồn xung quanh và thu các dải tín hiệu yếu, lý tưởng cho các RNA nhỏ và các mẫu đầu vào thấp.

• Xử lý hình ảnh thông minh. Phần mềm tự phát triển hỗ trợ phơi sáng tự động, lấy nét tự động và nâng cao hình ảnh tại điểm chụp. Nhấp một lần để có được kết quả được tối ưu hóa.

• Ứng dụng đa năng. Hỗ trợ ánh sáng truyền qua tia cực tím, xanh lam và trắng, cộng với quy trình làm việc huỳnh quang, đảm bảo khả năng tương thích thuốc nhuộm rộng rãi trên các gel axit nucleic.

• An toàn cho việc cắt bỏ gel. Cắt gel bên ngoài được hỗ trợ bằng tấm cắt tấm chắn tia cực tím tiêu chuẩn giúp ngăn chặn tia cực tím hiệu quả để bảo vệ người dùng trong quá trình cắt dải.

• Thiết kế tất cả trong một. Giao diện cảm ứng 12,1 inch tập trung điều khiển chạy, hình ảnh và phân tích để có trải nghiệm người dùng hợp lý.

• Quản lý dữ liệu và truy xuất nguồn gốc. Quản trị dựa trên vai trò, theo dõi kiểm tra hoàn chỉnh và ghi nhật ký được phân loại duy trì tính toàn vẹn và đơn giản hóa báo cáo theo quy định.

• Chú thích tự động đánh dấu. Chú thích điểm đánh dấu tự động làm giảm các bước thủ công và tăng cường khả năng tái tạo.

• Khả năng tương thích. Tích hợp sẵn sàng với thuốc thử, vết bẩn và công cụ phân tích hàng đầu hỗ trợ nghiên cứu axit nucleic và protein trên các hệ thống Longlight Gel Monitor.

Các khả năng này hợp lý hóa độ nhạy, tốc độ, an toàn và tuân thủ, cắt giảm thời gian giới thiệu và chuẩn hóa đầu ra giữa các nhóm làm việc trên các địa điểm.

Kết quả, Tuân thủ, mộtthứ hai một Cuộc gọi rõ ràng tHành động

Việc triển khai phương pháp điện di RNA tích hợp tạo ra thời gian quay vòng nhanh hơn, tài liệu nhất quán hơn và quy trình làm việc trên băng ghế an toàn hơn. Tích hợp chụp để ghi nhật ký trên một thiết bị duy nhất ngăn chặn sự phân mảnh quy trình làm việc và mất dữ liệu. Trong các hoạt động nghiêm ngặt về QC, dấu vết đánh giá từ đầu đến cuối neo xác nhận và hỗ trợ tuân thủ.

• Thu thập để báo cáo một bước giúp tăng tốc thông lượng.

• Hình ảnh rõ ràng, ánh sáng yếu của các RNA nhỏ và các mẫu bị xâm phạm.

• Nhận dạng thang tự động ổn định ước tính kích thước và giảm lỗi của con người.

• Quản trị dựa trên vai trò và theo dõi kiểm tra hoàn chỉnh cho phép truy xuất nguồn gốc ở cấp độ nghiên cứu.

• Máy trạm gel được che chắn bằng tia cực tím cải thiện độ an toàn cho việc cắt bỏ dây đeo.

Cách tiếp cận của Longlight Technology được xây dựng cho quy trình làm việc phân tử hiện đại. Nó giúp điện di RNA di chuyển theo tốc độ nghiên cứu của bạn, không phải tốc độ của các thiết bị của bạn. Nếu bạn đang hợp nhất các nền tảng hình ảnh, mở rộng quy mô RNA QC hoặc tìm kiếm tài liệu có thể truy xuất nguồn gốc mà không làm tăng thêm độ phức tạp, chúng tôi mời bạn đánh giá giải pháp một bước của chúng tôi.

Kêu gọi hành động

Liên hệ với Longlight Technology để yêu cầu bản demo và xem Hệ thống hình ảnh gel tất cả trong một của chúng tôi tăng tốc độ điện di RNA như thế nào - từ chụp đến đầu ra hình ảnh, với điều khiển cảm ứng 12,1 inch, xử lý tích hợp, ghi nhãn tự động và dữ liệu có thể truy xuất nguồn gốc. Nâng cấp hình ảnh gel của bạn lên quy trình làm việc nhanh hơn, an toàn hơn và chính xác hơn rõ rệt.