Điều gì làm cho Sonicator cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử trở nên cần thiết cho quy trình làm việc NGS

Máy siêu âm cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử sử dụng siêu âm hội tụ để phân mảnh DNA, phá vỡ tế bào và đồng nhất các mô với sự kiểm soát nhiệt độ chặt chẽ. Nó không tiếp xúc và chính xác. Các phòng thí nghiệm sử dụng nó để chuẩn bị thư viện NGS, phục hồi FFPE, ly giải vi sinh vật và chuẩn bị mẫu proteomics. Phương pháp này được áp dụng rộng rãi bởi các trung tâm bộ gen hàng đầu và được trích dẫn trên các quy trình làm việc được đánh giá ngang hàng trên toàn thế giới. Kết quả nhất quán và có thể mở rộng từ thử nghiệm đến sản xuất. Tuy nhiên, một câu hỏi vẫn còn: tại sao công cụ này lại trở thành xương sống thầm lặng của các phòng thí nghiệm giải trình tự hiện đại - và điều gì khiến nó khác biệt với các hệ thống thăm dò hoặc bồn tắm cũ hơn? Hãy ở lại với chúng tôi để tìm hiểu.

Tại sao một Sonicator cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử cung cấp năng lượng cho NGS đáng tin cậy

Tại Longlight Technology, chúng tôi gặp gỡ các nhóm vật lộn với ba vấn đề giống nhau: phân mảnh DNA không nhất quán, tổn thương do nhiệt gây ra và sự thay đổi do con người gây ra. Hệ thống đầu dò hoặc bồn tắm truyền thống lan truyền năng lượng âm thanh không đồng đều và phụ thuộc vào một bàn tay ổn định. Điều đó có nghĩa là trôi dạt từ lần chạy này sang lần khác, mất mẫu và chu kỳ khắc phục sự cố dài.

Cách tiếp cận tập trung của chúng tôi thay đổi điều đó. Bằng cách tập trung siêu âm tần số cao, bước sóng ngắn chính xác tại mẫu, việc chuẩn bị trở nên dễ đoán và lặp lại. Quá trình siêu âm xảy ra trong môi trường nước được kiểm soát, đẳng nhiệt, không tiếp xúc, vì vậy không có đầu dò chạm vào các mẫu quý giá và không có nguy cơ ô nhiễm tiềm ẩn. Hệ thống kiểm soát nhiệt độ có độ nhạy cao giữ cho khu vực mẫu ở nhiệt độ không đổi thực sự, bảo vệ sự phân bố kích thước mảnh và chất lượng thư viện hạ lưu.

Đối với NGS, những chi tiết đó rất quan trọng. Đường cong phân mảnh ổn định làm giảm độ lệch của thư viện. Xử lý sạch, không tiếp xúc bảo vệ vật liệu đầu vào thấp hoặc xuống cấp. Kiểm soát quy trình chặt chẽ hơn giúp giảm sự thay đổi giữa các lô và giữ cho tin sinh học không bù đắp cho tiếng ồn trong phòng thí nghiệm ướt. Nói tóm lại, một Sonicator cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử biến việc chuẩn bị mẫu từ một nghệ thuật thành một bước được thiết kế.

• Tín hiệu đằng sau tiêu chuẩn hóa

Chúng tôi hiệu chỉnh từng thiết bị để có hiệu suất đồng nhất. Lấy nét âm thanh và kiểm soát nhiệt độ loại bỏ các nguồn thay đổi phổ biến, vì vậy SOP của bạn mở rộng quy mô từ thí điểm đến sản xuất mà không cần viết lại cài đặt cho từng lô hoặc nhà điều hành. Kết quả là các đầu ra được tiêu chuẩn hóa mà các bước xuôi dòng - thắt bộ điều hợp, khuếch đại và lựa chọn kích thước - có thể phụ thuộc vào.

Cách công nghệ Longlight giải quyết các điểm đau khi chuẩn bị mẫu

Các phòng thí nghiệm NGS thường đạt mức trần thông lượng không phải vì khả năng giải trình tự, mà vì chuẩn bị là nút thắt cổ chai. Chúng tôi đã thiết kế nền tảng siêu âm tập trung của mình để giải quyết nút thắt cổ chai đó với các tính năng thiết thực, hàng ngày phù hợp với quy trình làm việc thực tế.

• Thông lượng song song mà không thỏa hiệp - Mười sáu vị trí mẫu Cho phép bạn xử lý các lô thực sự. Chạy 1 đến 16 ống cùng một lúc và đặt điều kiện cho mỗi mẫu khi cần thiết, vì vậy các mẫu nhạy cảm hoặc phức tạp sẽ được chăm sóc đặc biệt mà không làm chậm toàn bộ quá trình chạy.

• Chế độ hàng loạt cho công việc lặp lại - Đối với các đầu vào tương tự, hãy áp dụng hàng loạt các tham số và khởi chạy bằng một hành động. Điều này làm giảm thiết lập từng cú nhấp chuột và cắt giảm thời gian của người vận hành trong các công việc thông thường.

• Kiểm soát nhiệt độ thấp và không đổi thực sự - Một vòng điều khiển và cảm biến chính xác duy trì nhiệt độ mẫu trong suốt quá trình siêu âm. Bảo vệ tính toàn vẹn của mảnh và giảm thiểu các hiện vật nhiệt làm sai lệch cấu hình kích thước.

• Xử lý không tiếp xúc - Năng lượng tập trung truyền qua môi trường âm thanh đến ống. Không có đầu dò. Ít vectơ ô nhiễm hơn. Tự tin cao hơn khi xử lý vật liệu hạn chế hoặc không thể thay thế.

• Hồ sơ có thể truy xuất và truy xuất - Dữ liệu xử lý có thể được kéo lên bất cứ lúc nào. Điều đó làm cho việc điều tra QC nhanh hơn và hỗ trợ kiểm tra và chuyển giao phương pháp giữa các địa điểm.

• Thoát nước tự động và các biện pháp bảo vệ - Loại bỏ chất thải bằng một cú nhấp chuột, cảm biến mực nước và cảnh báo sớm ngăn ngừa sự cố tràn và thời gian ngừng hoạt động dọn dẹp.

• Yên tĩnh và khép kín - Hoạt động thoải mái mà không cần thêm hộp cách âm và không cần máy tính bên ngoài; hệ điều hành tích hợp giúp tiết kiệm không gian bàn làm việc và đơn giản hóa việc phê duyệt CNTT.

Cùng với nhau, những khả năng này làm cho Sonicator cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử trở thành một đầu cuối đáng tin cậy cho sự phân mảnh bộ gen, các tế bào và mô khó phân giải, quy trình làm việc FFPE và chuẩn bị mẫu liền kề với proteomics - mà không cần yêu cầu nhân viên của bạn trở thành chuyên gia siêu âm.

• Được thiết kế cho con người, không chỉ giao thức

Tính dễ sử dụng cũng quan trọng như vật lý. Tải ống, chọn thông số và chạy. Giao diện hỗ trợ cả điều khiển chi tiết và mẫu bắt đầu nhanh. Các thành viên mới trong nhóm bắt kịp tốc độ nhanh chóng, trong khi người dùng có kinh nghiệm có thể tinh chỉnh chu kỳ nhiệm vụ và chu kỳ mỗi lần nổ để tự tin đạt được kích thước mảnh mục tiêu.

Những gì mong đợi từ một Sonicator cho phòng thí nghiệm sinh học phân tử trong quy trình làm việc NGS

Thực hiện siêu âm hội tụ với Công nghệ Longlight thay đổi nhịp điệu trong phòng thí nghiệm của bạn. Hầu hết các nhóm đều thấy SOP ổn định nhanh hơn, ít lặp lại hơn và chuyển giao việc xây dựng thư viện suôn sẻ hơn. Bởi vì sự phân mảnh là nhất quán, việc lựa chọn kích thước ít lãng phí hơn và QC hạ nguồn vượt qua thường xuyên hơn trong lần thử đầu tiên.

Trong các đường ống gen điển hình, hệ thống tỏa sáng trong:

• Phân mảnh bộ gen cho quy trình đọc ngắn và kết hợp, trong đó các cửa sổ kích thước chặt chẽ mang lại chất lượng lập bản đồ.

• Gián đoạn tế bào và mô khi bạn cần axit nucleic nhanh, sạch và trên quy mô lớn.

• Các mẫu cứng (ví dụ: vi sinh vật khó hoặc FFPE) trong đó quá trình xử lý không tiếp xúc, kiểm soát nhiệt độ bảo vệ tính toàn vẹn.

Cũng quan trọng không kém, nền tảng hỗ trợ hai phong cách làm việc. Nếu bạn đang chạy các mẫu nghiên cứu khác nhau, bạn có thể chỉ định các điều kiện khác nhau cho từng ống và xử lý độ phức tạp trong một lô. Nếu bạn đang chạy một hàng đợi giống như sản xuất, các thông số hàng loạt cho phép bạn chuẩn hóa và đẩy công việc khối lượng lớn thông qua với thời gian tiếp xúc tối thiểu. Trong cả hai trường hợp, hồ sơ có thể truy xuất nguồn gốc giúp nhóm của bạn tìm hiểu nhanh chóng và khóa các cài đặt phù hợp nhất với vật liệu của bạn.

• Từ chất lượng dữ liệu đến kiểm soát chi phí

Phân mảnh vật lý tốt hơn chuyển thành kinh tế dữ liệu tốt hơn. Khi thư viện vượt qua QC lần đầu tiên, chi tiêu thuốc thử giảm và thời gian hoạt động của trình sắp xếp sẽ tăng lên. Hoạt động yên tĩnh và dấu chân tất cả trong một giúp giảm chi phí mềm của cơ sở hạ tầng và cấu hình lại băng ghế dự bị. Và vì quá trình xử lý không tiếp xúc và tự động, bạn bảo vệ thời gian của nhân viên khỏi việc làm lại có thể tránh được.

Thức Words

Bạn đã sẵn sàng chuẩn bị mẫu đáng tin cậy như máy giải trình tự của mình chưa? Nói chuyện với Longlight Technology về việc tích hợp Sonicator cho Phòng thí nghiệm Sinh học Phân tử vào quy trình làm việc NGS của bạn. Chúng tôi sẽ giúp bạn chọn thông số, xác thực kết quả và mở rộng quy mô từ chạy thử nghiệm đến sản xuất thông thường - mà không cần viết lại quy trình của bạn mỗi tuần.