Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng: không pha loãng, không làm lạnh, chỉ cần gel 5 phút

Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng là gì? Đây là một công nghệ đệm DNA cho phép bạn tiết kiệm nhiều thời gian nhất và không tạo thêm vấn đề cho khối lượng công việc tẻ nhạt của mình. Nhiều bộ đệm "nhanh" thương mại hứa hẹn phân tách nhanh chóng nhưng đưa ra những thách thức riêng: các bước pha loãng phức tạp, bảo quản lạnh bắt buộc và khả năng tương thích đáng ngờ với các ứng dụng hạ nguồn.

Công nghệ Longlight đã thiết kế Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X để tránh những cạm bẫy này. Kết quả là một bộ đệm agarose có độ bền ion thấp giúp giảm thời gian chạy 30 phút điển hình xuống còn 5–10 phút mà không cần xử lý đặc biệt hoặc chuẩn bị phức tạp.

Dưới đây là bảng phân tích rõ ràng về những gì làm cho Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng này thực sự thiết thực cho công việc phòng thí nghiệm hàng ngày.

Nền tảng kỹ thuật: cường độ ion thấp, ít nhiệt

Dung dịch đệm 1X TAE và TBE tiêu chuẩn có cường độ ion tương đối cao. Khi điện áp tăng, nhiệt độ Joule tăng mạnh, dẫn đến nhòe dải, biến dạng giếng và di chuyển không nhất quán. Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng sẽ cho phép điện áp cao hơn mà không có những tác dụng phụ này. Môi trường dẫn điện có độ mol thấp cung cấp một giải pháp đã được chứng minh.

Các nhà nghiên cứu bao gồm Jonathan R. Brody, Eric S. Calhoun, Eike Gallmeier, Talisa D. Creavalle và Scott E. Kern tại Trường Y Đại học Johns Hopkins đã chứng minh rằng việc giảm nồng độ ion sẽ cắt giảm sự sinh nhiệt một cách hiệu quả. Nghiên cứu của họ cho thấy môi trường có độ mol thấp "làm giảm nhiệt độ Joule của hệ thống điện di và cho phép tách các đoạn DNA dễ sử dụng, cực nhanh".

Những phát hiện trước đó của Singhal, Ren và Kern tại Johns Hopkins (2010) xác nhận rằng các điều kiện dẫn điện thấp hơn tạo ra tốc độ chạy nhanh hơn và phân tách dải sắc nét hơn cho các mảnh từ 100 bp đến 12 kb trong một gel duy nhất.

Cải thiện điện di DNA trong

Các điều kiện thuận lợi cho sự phức hợp polyborat và axit lewis | PLOS Một

Công nghệ Longlight đã áp dụng nguyên tắc này trực tiếp cho Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X. Bằng cách giữ tải ion thấp, bộ đệm cho phép điện áp lên đến 30 V / cm trong khi vẫn duy trì độ phân giải. Đó là kỹ thuật cốt lõi đằng sau Bộ đệm DNA đúc sẵn thực sự dễ sử dụng, mang lại tốc độ mà không bị ảnh hưởng.

Tại sao bộ đệm này làm giảm ma sát phòng thí nghiệm hàng ngày

Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng thực tế sẽ đơn giản hóa ba điểm khó khăn phổ biến: lỗi pha loãng, hậu cần lưu trữ và gián đoạn quy trình làm việc. Đây là cách Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X giải quyết từng cái.

• Không nhầm lẫn pha loãng: Pha loãng cô đặc 50X 1:50 với nước cất để thu được dung dịch làm việc 1X. Không cần điều chỉnh pH, không tính toán thêm. Sử dụng cùng một dung dịch đệm 1X để đúc và chạy gel để giữ độ bền ion nhất quán.

• Không cần làm lạnh: Cả kho 50X và dung dịch đệm 1X pha loãng vẫn ổn định ở nhiệt độ phòng trong ít nhất 12 tháng. Các phòng thí nghiệm có thể lưu trữ dung dịch đệm trên băng ghế, giải phóng không gian lạnh cho các enzym và kháng thể.

• Không chờ gel: Thiết kế nhiệt độ thấp hỗ trợ 25–30 V / cm. Quá trình tách thường mất 30 phút sẽ kết thúc trong 5–10 phút. Điều này làm tăng thông lượng cho các phòng thí nghiệm xử lý nhiều mẫu mỗi ngày.

• Không cần tách: dung dịch đệm này cung cấp khả năng chiết xuất và thắt gel. Người dùng thậm chí có thể thực hiện các bước giải trình tự hoặc nhân bản ngay sau khi cắt dải và phân phối bộ đệm.

• Khả năng tái sử dụng hoàn toàn: Dung lượng bộ đệm tuyệt vời của bộ đệm không thay đổi sau khi sử dụng cho lần chạy hai mươi mốt. Nó tiết kiệm nhiều tiền hơn và giảm nhiều chất thải hơn đến từ việc sử dụng bộ đệm.

Tại sao các phòng thí nghiệm đang chuyển sang căn chỉnh thị trường bộ đệm nhanh hơn, đơn giản hơn

Thị trường điện di dự kiến sẽ tăng lên 4,47 tỷ USD vào năm 2033 từ 2,72 tỷ USD vào năm 2024. Điều này tương đương với tốc độ CAGR 5,7%. Sự tăng trưởng này được thúc đẩy bởi việc tăng cường nghiên cứu bộ gen, chẩn đoán phân tử và sàng lọc thông lượng cao. Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng phù hợp trực tiếp với xu hướng này: phòng thí nghiệm cần thời gian quay vòng nhanh hơn, nhưng họ cũng cần các phương pháp tích hợp liền mạch với quy trình làm việc hiện có.

Gel agarose đúc sẵn đã được áp dụng rộng rãi vì chúng cung cấp chất lượng ổn định và tiết kiệm thời gian đúc. Tuy nhiên, bộ đệm đang chạy vẫn là một biến quan trọng. Dung dịch đệm yêu cầu bảo quản lạnh, pha loãng phức tạp hoặc xử lý đặc biệt làm chậm toàn bộ quá trình. Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X giúp mọi thứ đơn giản trong khi vẫn theo kịp nhu cầu phòng thí nghiệm hiện đại. Cân bằng tốc độ và khả năng sử dụng đã cho phép Longlight Technology phát triển sản phẩm của mình.

Ví dụ về phòng thí nghiệm bê tông

Các ứng dụng thực tế cho Bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng, nơi có thể tiết kiệm thời gian đáng kể bao gồm:

• Xác minh các sản phẩm PCR: Nhanh chóng chạy gel xác nhận trên các sản phẩm PCR trong 5-10 phút, kiểm tra kết quả và quyết định các bước tiếp theo cho các ứng dụng giải trình tự hoặc hạ nguồn.

• CRISPR hoặc phản hồi thử nghiệm thông báo: Đánh giá nhanh các kết quả như hiệu quả của các chỉnh sửa hoặc thông báo và thực hiện các điều chỉnh cho các thử nghiệm trong ngày.

• Kiểm soát chất lượng trên thư viện NGS: Kiểm soát chất lượng của thư viện NGS có thể giúp tránh hoặc giảm thiểu trình tự không thành công khi chạy NGS.

• Sinh học tổng hợp: Khép lại chu trình thiết kế bằng cách tổng hợp các cấu trúc, chỉnh sửa để xác minh trình tự và sửa đổi cho phù hợp, không lãng phí thời gian giữa mỗi chu kỳ.

• Sàng lọc mục tiêu thuốc: Tránh làm mất độ rõ ràng của dải trong các thí nghiệm sàng lọc thông lượng cao bằng cách tăng hiệu quả của sàng lọc bộ mẫu lớn.

Dễ sử dụng

Sử dụng Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X có thể được thực hiện từng bước mà không cần môn học để luyện tập.

Bước 1 - Chuẩn bị dung dịch đệm 1X: Thêm 20 mL chất cô đặc 50X vào 980 mL nước cất và trộn. Bộ đệm 1X có thể được bảo quản ở nhiệt độ phòng.

Bước 2 - Đúc và chạy gel: Sử dụng cùng một dung dịch đệm 1X cho agarose và điện di. Chạy trong khoảng 25-30 V / cm chiều dài của gel agarose. Gel không yêu cầu bất kỳ thay đổi nào đối với các phương pháp nhuộm.

Bước 3 – Xem gel và đưa ra quyết định: Vết DNA có thể được đưa vào trong quá trình đúc gel hoặc gel có thể được ngâm trong vết bẩn sau điện di. Các dải có thể nhìn thấy rõ ràng và có thể được cắt bỏ cho các quy trình hạ lưu.

Tóm tắt

Dung dịch đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng phải chính xác như vậy: dễ pha loãng, dễ bảo quản và dễ tích hợp vào quy trình làm việc hiện có. Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X từ Công nghệ Longlight đạt được cả ba. Nó cắt giảm thời gian chạy từ 30 phút xuống còn 5–10 phút bằng cách giảm thiểu sinh nhiệt, nhưng nó không yêu cầu làm lạnh, không xử lý phức tạp và không có thêm các bước dọn dẹp. Đối với các phòng thí nghiệm coi trọng cả tốc độ và độ tin cậy, bộ đệm này cung cấp một bản nâng cấp đơn giản.

Để biết thêm thông tin, để yêu cầu báo giá hoặc đặt hàng, hãy truy cập www.longlight.com hoặc liên hệ trực tiếp với nhóm Công nghệ Longlight.

Câu hỏi thường gặp

Q: Bộ đệm chạy siêu nhanh 50X có thực sự là một bộ đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng không?

A: Chắc chắn rồi. Không có tính toán pha loãng phức tạp hoặc điều chỉnh pH. Ngoài ra, không cần làm lạnh. Chỉ cần pha loãng 50X trong nước cất 1:50, để nó ở RT và nó đã sẵn sàng cho 5 phút chạy gel!

Q: Bộ đệm này có thể tái sử dụng được không?

A: Chắc chắn rồi! Do khả năng đệm mạnh của bộ đệm, cùng một giải pháp làm việc 1X có thể được sử dụng nhiều lần, giảm cả lãng phí và chi phí cho mỗi thử nghiệm!

Q: Bộ đệm của bạn tuyên bố tương thích với các hệ thống điện di và nhuộm khác nhau. Điều này có thực sự đúng không?

A: Vâng! Bạn có thể sử dụng bộ đệm này làm 1X cho cả gel và để chạy nó. Bạn có thể đổ gel với thuốc nhuộm DNA của mình và ngâm nó sau e để nhuộm. Bạn có thể cá nhân hóa thiết kế của mình theo ý mình!

Q: Dung dịch đệm DNA đúc sẵn dễ sử dụng có hại cho việc thắt hoặc chiết xuất gel không?

A: Chắc chắn là không! Bạn có thể cắt các dải mong muốn và thực hiện trình tự mà không cần thực hiện thêm bất kỳ quá trình thanh lọc nào!

Câu hỏi: Bộ đệm này có thể ở lại RT trong 12 tháng không?

A: Vâng. Cả bộ đệm 50X và bộ đệm đã chuẩn bị 1X đều ổn định ở RT trong 12 tháng. Bạn không phải lo lắng về việc bộ đệm bị lạnh!